Ligin ilk haftasında deplasmanda oynanan Büyükşehir Gaziantepspor müsabakasında sakatlanan Emre Can'ın yerine 44'üncü dakikada oyuna dahil olan ve ardından 5 müsabakanın tamamında 90 dakika görev yapan oyuncu için Başakşehir'le şimdiden temasa geçildiği öğrenildi.
Medipol Başakşehir Teknik Direktörü Abdullah Avcı'nın da Gençer'in Göztepe'ye verilmesine sıcak baktığı, tecrübeli stoperin Ocak 2017'de başlayacak ara transferde bonservisiyle Göztepe'ye geçeceği kaydedildi.
Geçen sezonun devre arasında da Başakşehir'den kiralanan Gençer lig bitiminde kulübüne dönmüş ancak sarı kırmızılılar oyuncuyu bir kez daha kadrosuna katmıştı. Göztepe formasını geçen sezon 17, bu sezon da 6 maçta giyen 27 yaşındaki futbolcu istikrarlı bir görüntü ortaya koydu.
